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上?萍即髮W成功舉辦生物信息學基礎培訓

2019年4月19日至20日,我校成功舉辦了為期兩天的生物信息學基礎培訓。這次培訓由我校免疫化學研究所生物醫學大數據平臺發起和主持,圖信中心云桌面教室以及人字樓報告廳舉行,生命科學口的一百余位老師和同學們參與了培訓。

生物信息學是利用數學、信息學、統計學和計算機科學的方法研究生物學問題的一門交叉學科。生物信息學的具體內容包括對生物學數據進行儲存、搜索、處理以及利用。隨著高通量數據特別是基因組學數據在生命科學研究中的大量使用,生命科學的發展越來越離不開生物信息學的應用。生物信息學是一門實踐性很強的學科,有針對性的培訓在該學科的教育中有舉足輕重的作用。

本次培訓的內容包括了生物信息學概述,以及R語言、Linux基礎和RNA-SEQ數據分析的實戰演練。19日上午,生信技能樹的曾健明先生在人字樓報告廳概述了生物信息學以及各種學習資源,他強調了學習生物信息學貴在行動力和堅持,在現場帶領大家安裝基本的生信軟件如Rstudio, git bash等。19日下午以及20日全天的實戰培訓在我校圖信中心的云桌面實訓教室進行。R語言、Linux基礎和RNA-SEQ數據分析的實訓由我校免疫化學所生物醫學大數據平臺的蔣立春博士、王瑋博士和宋珂博士擔任主講人。來自上海中醫藥大學、我校生命科學與技術學院以及生信技能樹的多位生信專家和生信實踐者擔任了培訓現場助教,幫助學員們及時解決培訓操作中遇到的各種具體技術問題。 圖信中心云桌面實訓教室先進的多媒體和云計算技術,也為講師和學員們提供了良好的體驗。

低年級研究生(一,二年級)占這次學員總數的四成以上,有一半以上的學員表示研究中或課題組經常遇到需要應用生物信息學來處理的問題,其中絕大多數學員表示需要找公司或者合作者解決這些問題,此次培訓對他們有很大幫助,也紛紛表示會積極參加后續相關培訓。希望此次培訓能讓學員們系統了解和掌握生物信息學的基礎知識和應用,為我校后續更深入的生物信息學培訓打好基礎,也能為大家利用生物信息學工具開展生命科學研究提供助力。

圖1 在人字樓報告廳,曾健明講述生物信息學概述


圖2 在我校圖書信息中心的云桌面實訓教室開展實戰演練為主的培訓


 
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